Desarrollo de plugin para el análisis de datos generados por secuenciación de alto rendimiento

Quintero Lopez, Juan Camilo

Publicación:
Desarrollo de plugin para el análisis de datos generados por secuenciación de alto rendimiento

dc.audience	Comunidad Científica y Académica	spa
dc.contributor.advisor	Pardo Calvache, César Jesús	spa
dc.contributor.author	Quintero Lopez, Juan Camilo	spa
dc.date.accessioned	2014-08-15T15:08:33Z
dc.date.available	2014-08-15T15:08:33Z
dc.date.issued	2013
dc.date.submitted	2014
dc.description.abstract	NGSEP representa una solución importante para los problemas de integración y usabilidad presente en las actuales herramientas de bioinformática, en este sentido, NGSEP es un plugin de software programado en el lenguaje Java con SWT biblioteca de componentes gráficos. Con esta esta herramienta un usuario final puede realizar diferentes procesos de NGS (Next generation Sequencing). NGSEP garantiza tiempo de carga de archivos genéticos, almacenamiento local de archivos genéticos, distribución y mantenimiento de versiones del software. NGSEP integra a NGSTools que es un marco integrado para el descubrimiento de las variantes genómicas de los datos producidos por NGS. Integra algoritmos desarrollados anteriormente para la detección SNPs, CNV con implementaciones en Java, esta librería fue desarrollada por el Dr. Jorge Duitama Castellanos investigador en bioinformática de CIAT.	spa
dc.format.medium	Recurso en linea	spa
dc.format.mimetype	application/pdf	spa
dc.identifier.uri	http://hdl.handle.net/10819/2155
dc.language.iso	spa	spa
dc.publisher.faculty	Ingenierias	spa
dc.publisher.program	Ingenieria de Sistemas	spa
dc.publisher.sede	Cali	spa
dc.rights.accessrights	info:eu-repo/semantics/openAccess	spa
dc.rights.licencia	Por medio de este formato manifiesto mi voluntad de AUTORIZAR a la Universidad de San Buenaventura, Sede Bogotá, Seccionales Medellín, Cali y Cartagena, la difusión en texto completo de manera gratuita y por tiempo indefinido en la Biblioteca Digital Universidad de San Buenaventura, el documento académico-investigativo objeto de la presente autorización, con fines estrictamente educativos, científicos y culturales, en los términos establecidos en la Ley 23 de 1982, Ley 44 de 1993, Decisión Andina 351 de 1993, Decreto 460 de 1995 y demás normas generales sobre derechos de autor. Como autor manifiesto que el presente documento académico-investigativo es original y se realiza sin violar o usurpar derechos de autor de terceros, por lo tanto, la obra es de mi exclusiva autora y poseo la titularidad sobre la misma. La Universidad de San Buenaventura no será responsable de ninguna utilización indebida del documento por parte de terceros y será exclusivamente mi responsabilidad atender personalmente cualquier reclamación que pueda presentarse a la Universidad. Autorizo a la Biblioteca Digital de la Universidad de San Buenaventura convertir el documento al formato que el repositorio lo requiera (impreso, digital, electrónico o cualquier otro conocido o por conocer) o con fines de preservación digital. Esta autorización no implica renuncia a la facultad que tengo de publicar posteriormente la obra, en forma total o parcial, por lo cual podrá, dando aviso por escrito con no menos de un mes de antelación, solicitar que el documento deje de estar disponible para el público en la Biblioteca Digital de la Universidad de San Buenaventura, así mismo, cuando se requiera por razones legales y/o reglas del editor de una revista.	spa
dc.source.instname	Universidad de San Buenaventura - Cali	spa
dc.source.other	Biblioteca USB, Cali. T005.12 Q7 CD-ROM	spa
dc.source.reponame	Biblioteca Digital Universidad de San Buenaventura	spa
dc.subject	Plugín	spa
dc.subject	Sofware	spa
dc.subject	Bioinformática	spa
dc.subject	Ingeniería	spa
dc.subject	Secuenciación de alto rendimiento	spa
dc.subject	CIAT biología	spa
dc.subject.lemb	Diseño de software	spa
dc.subject.lemb	Desarrollo de software	spa
dc.subject.lemb	Análisis de datos	spa
dc.thesis.name	Ingeniero de Sistemas	spa
dc.title	Desarrollo de plugin para el análisis de datos generados por secuenciación de alto rendimiento	spa
dc.type	Trabajo de grado - Pregrado	spa
dc.type.driver	info:eu-repo/semantics/bachelorThesis	spa
dc.type.spa	Trabajo de Grado	spa
dspace.entity.type	Publication	spa